Independen -- Tiga pasangan calon Gubernur dan Wakil Gubernur Aceh mendaftar dari jalur independen. Mereka adalah Zakaria Saman dan Teuku Alaidinsyah. Lalu Abdullah Puteh dan Sayed Mustafa. Dalam politik Aceh, Puteh bukan nama asing. Ia pernah menduduki kursi Aceh Satu dari tahun 2000 hingga 2004. Kariernya berakhir setelah Komisi Pemberantasan Korupsi menetapkan status tersangka dalam kasus pengadaan helikopter buatan Rusia. Puteh ditahan dan dihukum di LP Suka Miskin Jawa Barat hingga 2014 lalu.
Baca: Abdullah Puteh Ramaikan Bursa Pilkada Aceh
Pasangan independen yang mendaftar saat hari terakhir pendaftaran adalah Zaini Abdullah dan Nasaruddin. Zaini Abdullah adalah incumbent. Ia merupakan pentolan Gerakan Aceh Merdeka, yang saat ini menjabat Gubernur Aceh. Ia terpilih sebagai gubernur dalam pilkada 9 April 2012 setelah berpasangan dengan Muzakir Manaf, yang diusung Partai Aceh.
Baca: Zaini Abdullah Serahkan 200 Ribu KTP
Sedangkan pendaftaran jalur partai politik akan dibuka 19 – 21 September 2016. Meski begitu Partai Demokrat resmi mengumumkan bakal calon gubernur dan wakil gubernur dalam pemilihan kepala daerah Aceh 2017. Partai ini akan mengusung Irwandi Yusuf yang akan berduet dengan Nova Iriansyah.
